بسم الله الرحمن الرحيم
الصلاة والسلام على اشرف المرسلين صلى الله عليه وسلم
السلام عليكم ورحمة الله
أفضل توزيعات Linux للمجتمعات الطبية والعلمية
1- Lin4Neuro
أفضل 7 توزيعات Linux للمجتمعات الطبية والعلمية
Lin4Neuro
هو توزيعة أوبونتو مخصصة خاصة لتحليل التصوير العصبي. تم تطويره من قبل Kiyotaka Nemoto (أستاذ مشارك في قسم الطب النفسي ، كلية الطب ، جامعة تسوكوبا ، اليابان). يمكن أن يكون Lin4Neuro تمهيديًا جيدًا للمبتدئين في تحليل التصوير العصبي أو الطلاب المهتمين بتحليل التصوير العصبي. كما يوفر وسيلة عملية لتبادل بيئات التحليل عبر المواقع.
التطبيقات
3D Slicer
خوارزميات تحليل الصور لتصوير موتر الانتشار والتصوير بالرنين المغناطيسي الوظيفي والعلاج الموجه بالصورة.
AFNI - لمعالجة وعرض بيانات التصوير بالرنين المغناطيسي الوظيفية.
مجموعة أدوات التصوير بالرنين المغناطيسي للتصوير بالرنين المغناطيسي من UCL - لمعالجة التصوير بالرنين المغناطيسي.
الإقحام - يمكّن المستخدم من إنشاء وعرض ومعالجة إعادة بناء السطح للقشرة الدماغية والقشرية المخيخية.
محلل Connectome - تحليل الروابط من أي مصدر (DSI ، DTI ، QBall ، rs-fMRI ، إلخ ...) بمقاييس مختلفة (عالمية وشبكات فرعية ومحلية).
Connectome Viewer - يربط التصوير العصبي متعدد الوسائط ومجموعات البيانات الشبكية للتحليل والتصور في Python.
DSI Studio - لتحليل صور MR للنشر.
FSL - تحليل الصور والأدوات الإحصائية لبيانات تصوير الدماغ بالرنين المغناطيسي والتصوير بالرنين المغناطيسي.
Ginkgo CADx
برنامج تصوير طبي مفتوح المصدر قابل للتوسيع متعدد المنصات يوفر حل عارض DICOM الكامل.
ITK-Snap
هياكل القطعة في الصور الطبية ثلاثية الأبعاد.
مجموعة أدوات Minc - معالجة ملفات MINC.
MITK
لتطوير برامج معالجة الصور الطبية التفاعلية.
MITK Diffusion
مجموعة مختارة من خوارزميات تحليل الصور لمعالجة صور MR الموزونة على الانتشار.
MRIConvert
أداة تحويل ملف صورة طبية تحول ملفات DICOM إلى NIfTI 1.1 و Analyze 7.5 و SPM99 / Analyze و BrainVoyager و MetaImage.
التصوير بالرنين المغناطيسي - أداة التصور والتحليل المستندة إلى واجهة المستخدم الرسومية للتصوير بالرنين المغناطيسي (الوظيفية).
MRtrix
مجموعة من الأدوات لأداء جهاز مسح المادة البيضاء الموزون بالانتشار الموزون بطريقة متينة في عبور الألياف ، باستخدام التفكيك الكروي المقيّد (CSD) وتبسيط الاحتمالية.
التصوير بالرنين المغناطيسي الظاهري - محاكاة واقعية لماسح التصوير بالرنين المغناطيسي.
مرجع
الصفحة الرئيسية
2- بيو لينكس
أفضل 7 توزيعات Linux للمجتمعات الطبية والعلمية
Bio-Linux
هو نظام أساسي قوي ومجاني لمحطات المعلوماتية الحيوية يمكن تثبيته على أي شيء من كمبيوتر محمول إلى خادم كبير ، أو تشغيله كآلة افتراضية. يضيف Bio-Linux أكثر من 250 حزمة معلوماتية حيوية لقاعدة Ubuntu Linux ، مما يوفر حوالي 50 تطبيقًا رسوميًا وعدة مئات من أدوات سطر الأوامر. يتم أيضًا تضمين بيئة Galaxy لتحليل البيانات المستندة إلى المستعرض وبناء سير العمل في Bio-Linux.
التطبيقات
هناك أكثر من 250 حزمة معلوماتية حيوية ، ومن الأمثلة على ذلك:
الهاوية - دي نوفو ، متوازي ، متسلسل للقراءات القصيرة.
الأركيوبتركس - عارض شجرة وتحرير السلالات.
أرتميس - عارض الجينوم المجاني وأداة التعليقات التوضيحية.
اكسيوم - مجموعة أدوات QIIME وأتمتة الأوتار.
bamtools
مجموعة أدوات لمعالجة ملفات BAM (محاذاة الجينوم).
الانفجار الكبير - سيناريو الانفجار الكبير للتعليق على سلاسل طويلة.
blast2
أداة بحث المحاذاة المحلية الأساسية.
bowtie2
محاذاة قراءة قصيرة فائقة الموفرة للذاكرة فائقة السرعة.
catchall
تحليل البيانات حول وفرة الأنواع الميكروبية.
emboss
مجموعة البرامج المفتوحة للبيولوجيا الجزيئية الأوروبية.
estscan2
يكتشف مناطق تشفير تسلسل الحمض النووي.
fasta
مجموعة من البرامج للبحث في قواعد بيانات DNA والبروتين.
galaxy-server
بيئة تحليل قائمة على الويب للمعلوماتية الحيوية.
جالفيو - محرر محاذاة متعددة.
لوسي - إعداد شظايا تسلسل الحمض النووي الخام لتجميع التسلسل.
مجموعة تحليل تسلسل mothur للبحث عن الكائنات الحية الدقيقة.
ncbi-blast +
مجموعة الجيل التالي من أدوات البحث عن تسلسل BLAST.
rasmol
تصور الجزيئات البيولوجية.
ssake
تطبيق الجينوم لتجميع الملايين من تسلسلات الحمض النووي القصيرة جدا.
سرب - طريقة تجمع قوية وسريعة للدراسات القائمة على أمبليكون.
مرجع
الصفحة الرئيسية
3- فيدورا الروبوتات
أفضل 7 توزيعات Linux للمجتمعات الطبية والعلمية
تقدم Fedora Robotics spin مجموعة متنوعة من حزم برامج الروبوتات المجانية والمفتوحة. وتتراوح هذه من مكتبات ملحقات الأجهزة لأجهزة المسح الضوئي بالليزر Hokuyo أو الذراع الروبوتية Katana إلى أطر البرامج مثل Fawkes أو Player وبيئات المحاكاة مثل Stage و RoboCup Soccer Simulation Server 2D / 3D. كما يوفر أيضًا بيئة جاهزة للاستخدام لتطوير الروبوتات بما في ذلك المكتبات المفيدة مثل مكتبة رؤية الكمبيوتر OpenCV ، نظام مهرجان النص إلى الكلام و MRPT.
التطبيقات
لاعب - خادم وإطار الروبوت لأنظمة الروبوتات المتقدمة.
Gazebo
محاكاة الروبوتات ثلاثية الأبعاد القوية والقوية مع الفيزياء الواقعية.
Arduino
بيئة التطوير لمنصة الأجهزة مفتوحة المصدر Arduino.
Fawkes
إطار معياري للأنظمة الروبوتية عالية الأداء.
SimSpark
المحاكاة الفيزيائية لأبحاث الروبوتات متعددة الوكلاء.
المرحلة - محاكاة 2.5D مرنة لأجهزة الاستشعار الروبوتية والحركة.
PCL
مشروع مستقل واسع النطاق مفتوح للصورة ثنائية الأبعاد / ثلاثية الأبعاد ومعالجة سحابة النقاط.
MRPT
المكتبات والتطبيقات لتطوير نظام الروبوتات.
كسوف - IDE قوي وقابل للتوسع متعدد اللغات.
مرجع
الصفحة الرئيسية
4- علم الفلك فيدورا
أفضل 7 توزيعات Linux للمجتمعات الطبية والعلمية
توفر Fedora Astronomy سطح مكتب Fedora KDE المحسن ببيئة Python علمية كاملة وبرنامج AstrOmatic لتحليل البيانات. تمت إضافة KStars لتوفير أداة تصوير فلكي كاملة المواصفات. نظرًا لأن KStars يستخدم مكتبة INDI للتحكم في المعدات ، يتم دعم التلسكوبات والكاميرات المختلفة وما إلى ذلك.
التطبيقات
Astropy
مكتبة بيثون المجتمع لعلم الفلك لتعزيز قابلية التشغيل البيني بين حزم علم الفلك.
Virtualplanet - يسمح لك بتصور أي جانب من جوانب الكوكب في أي وقت.
Kstars
يوفر محاكاة رسومية دقيقة لسماء الليل ، من أي مكان على الأرض ، في أي تاريخ ووقت.
سيريل - برنامج مجاني لمعالجة الصور الفلكية.
Celestia
محاكاة الفضاء الحر التي تتيح لك استكشاف عالمنا في ثلاثة أبعاد.
INDI
برنامج عبر منصة مصمم لأتمتة والتحكم في الأدوات الفلكية.
AstrOmatic
مجموعة من برامج خطوط الأنابيب الفلكية.
GIMP
تطبيق قوي لتكوين الصور وتحرير الرسومات ، يشبه Adobe® Photoshop ™.
مرجع
الصفحة الرئيسية
5- بوسيدون لينكس
أفضل 7 توزيعات Linux للمجتمعات الطبية والعلمية
Poseidon Linux (src: wikipedia)
يعتمد Poseidon Linux على Ubuntu (سابقًا في Kurumin / Knoppix) ويستهدف المجتمع العلمي الدولي (الطلاب والفنيين والأساتذة والباحثين). يقدم العديد من الأدوات المحددة في مجالات قياس الأعماق ، رسم خرائط قاع البحر ، نظم المعلومات الجغرافية والتصور ثلاثي الأبعاد. البرنامج الرئيسي:
MB-System
حزمة برمجيات مفتوحة المصدر لمعالجة وعرض بيانات قياس الأعماق وصور الانتثار الخلفي المستمدة من الحزم المتعددة والتداخل السونار والسونار الجانبي.
GMT
(أدوات رسم الخرائط العامة) - مجموعة مفتوحة المصدر تضم حوالي 80 أداة لسطر الأوامر للتعامل مع مجموعات البيانات الجغرافية والديكارتيية.
حزم نظم المعلومات الجغرافية .
مرجع
الصفحة الرئيسية
6- دبيان ميد
أفضل 7 توزيعات Linux للمجتمعات الطبية والعلمية
دبيان ميد ليست توزيعة لينكس قائمة بذاتها ، ولكنها مجموعة من الحزم للممارسة الطبية والبحوث الطبية الحيوية ، والتي يمكن تثبيتها في نظام ديبيان أو مشتق ديبيان. يحتوي على 1039 عبوة يتم تجميعها حسب metapackages. سوف تتسبب كل صفحة metapackage في تثبيت الحزم لموضوع معين. تعمل Debian Med معًا بشكل وثيق مع Bio-Linux.
التطبيقات
علم الأحياء - حزم المعلوماتية الحيوية.
تطوير علم الأحياء - حزم لتطوير تطبيقات المعلوماتية الحيوية.
تسلسل الجيل التالي - تطبيقات المعلوماتية الحيوية القابلة للاستخدام في تسلسل الجيل التالي.
نسالة حزم نسالة -.
السحابة - تطبيقات المعلوماتية الحيوية القابلة للاستخدام في الحوسبة السحابية.
إدارة المحتوى - أنظمة إدارة المحتوى.
البيانات الطبية - قواعد بيانات الأدوية.
طب الأسنان - حزم تتعلق بممارسة طب الأسنان.
علم الوبائيات - حزم الوبائيات المتعلقة.
أنظمة معلومات المستشفيات - اقتراحات دبيان ميد لأنظمة معلومات المستشفيات.
التصوير - حزم معالجة الصور والتصور.
تطوير التصوير - تطوير حزم التصور والتصور.
مختبر - اقتراحات ديبيان ميد للمختبرات الطبية.
علم الأورام - حزم الأورام.
علم الصيدلة - حزم للبحوث الصيدلانية.
الفيزياء - حزم للفيزيائيين الطبيين.
الممارسة - حزم لإدارة الممارسة.
علم النفس - حزم لعلم النفس.
إعادة التأهيل - حزم لتقنيات إعادة التأهيل.
البحث - حزم للبحوث الطبية.
إحصائيات - حزم للإحصاءات.
أدوات - دبيان ميد عدة أدوات.
تنضيد الحروف - دعم التنضيد والنشر.
مرجع
الصفحة الرئيسية
7- NeuroDebian
أفضل 7 توزيعات Linux للمجتمعات الطبية والعلمية
NeuroDebian
ليست توزيعة لينكس قائمة بذاتها ، ولكنها مجموعة من برامج أبحاث علم الأعصاب المتوفرة لنظام التشغيل Windows و macOS و Debian و Ubuntu Linux. لديها مجموعة كبيرة من الحزم لـ:
الحوسبة الموزعة.
الفيزيولوجيا الكهربية.
تصوير العقل المغناطيسي.
نمذجة النظم العصبية.
مجموعات بيانات علم الأعصاب.
تعليم علم الأعصاب.
الفيزياء النفسية.
مرجع
الصفحة الرئيسية
استنتاج
تغطي الخيارات المذكورة أعلاه تخصصات متنوعة ، وهناك أيضًا توزيعات لينكس أخرى تستهدف المجتمعات الطبية والعلمية ولكن لم يتم تطويرها بنشاط بعد الآن ، مثل Scientific Linux و OSDDlinux و BioSLAX . عالم لينكس شاسع ويمكن للجميع العثور على توزيعة تناسب احتياجاته الخاصة أو حتى تخصيصها إذا كان لديه المعرفة للقيام بذلك.
المشاركات
ليست هناك تعليقات:
إرسال تعليق
(( مَا يَلْفِظُ مِنْ قَوْلٍ إِلَّا لَدَيْهِ رَقِيبٌ عَتِيدٌ))